| dbo:abstract
|
- Els factors sigma o factors σ són proteïnes que es troben en procariotes com subunitats de l'ARN polimerasa. Li permeten reconèixer les seqüències promotores de l'ADN per iniciar la transcripció. Els factors sigma més comuns són els factors σ70 i σ54. (ca)
- عامل سيغما عامل سيغما σ هو بروتين ضروري فقط لبدء تركيب الحمض النووي الريبسومي، وهو عامل تحفيزي لبدء النسخ في البكتيريا يساعد في الربط بين الإنزيم الذي يقوم بنسخ الحمض النووي (DNA Polymerase) والجينات اللازمة لبدء نسخ الحمض النووي . يختلف عامل سيغما المتخصص اللازم لبدء نسخ جين معين من جين لأخر اعتماداً على الجينات وعلى الاشارات البيئية اللازمة لبدء نسخ من هذا الجين، يعتمد اختيار الجين للربط بالإنزيم لبدء النسخ على عامل سيغما المصاحب له، حيث يحتوي كل جزيء من الإنزيم الذي يقوم بنسخ الحمض الريبوسومي (RNA Polymerase) على وحدة صغيره من عامل سيغما، يوجد في البكتريا النموذجية الايشريشيا كولاي واحد من تلك العوامل المذكورة أدناه.عدد عوامل سيغما يختلف بين فصائل البكتريا المختلفة فمثلاً بكتيريا الايشريشيا كولاي تحتوي سبعة من عوامل سيغما، وهذه العوامل تتميز عن بعضها بأوزانها الجزيئية المميزة لهم، على سبيل المثال يشير σ70 إلى عامل سيغما مع الوزن الجزيئي 70 كيلو دالتون.يقوم إنزيم البلمرة المتكون من الإنزيم الناسخ للحمض الريبوسومي وجزيء عامل سيغما بالنسخ من قالب الحمض النووي، وبمجرد اكتمال البدء في نسخ الحمض الريبوسومي فان عامل سيغما يسيتطيع مغادرة الرابطة. (ar)
- Sigma faktor (σ faktor) je podjednotka bakteriálních DNA-dependentních RNA polymeráz, která umožňuje počáteční fázi (iniciaci) transkripce a výběr promotoru. Každá bakteriální RNA polymeráza se před vlastním procesem transkripce musí navázat na sigma faktor a vzniklý komplex přisedne na promotor na vlákně DNA. Když dosáhne velikost vzniklé RNA asi 8–10 nukleotidů, tento RNA řetězec způsobí disociaci (vyvázání) sigma faktoru. Po dokončení transkripce vlákna se RNA polymeráza uvolní do cytosolu a opět může navázat nový sigma faktor. Bakterie mívají mnoho různých sigma faktorů. Jeden z nich je určený pro běžný provoz buňky, ostatní se vyznačují různými specifickými vazebnými vlastnostmi a umožňují bakteriím jednoduše změnit transkripční program. Výměna sigma faktorů je obvykle reakce na změnu podmínek v okolním prostředí. (cs)
- Sigma-Faktoren (σ-Faktoren) sind bakterielle Proteine, welche für die Initiation der Transkription notwendig sind. In der Regel sind Sigma-Faktoren in der Zelle an die RNA-Polymerase gebunden. Eine vollständige bakterielle Polymerase mit gebundenem Sigma-Faktor wird oft auch als Holoenzym bezeichnet. Sie besteht aus sechs Untereinheiten (α2ββ’ωσ). Das Minimal- oder Coreenzym dagegen ist nicht an die σ-Untereinheit gebunden. In anderen Zusammenhängen ist die Bedeutung von Holoenzym allerdings oft eine andere. Sigma-Faktoren weisen eine hohe Affinität zur Pribnow-Box und der -35-Sequenz des Promotors auf. Damit erhöht sie die Bindewahrscheinlichkeit des Polymerase-Holoenzyms an die Startstelle des offenen Leserahmens der DNA. Auch ohne Sigma-Faktor kann die RNA-Polymerase an die DNA binden, doch es kommt nicht zur Transkription. Wenn das Polymerase-Holoenzym den offenen Komplex bildet und die Transkription beginnt, wird der Sigma-Faktor abgespalten. Abhängig von den Umweltbedingungen exprimieren Bakterien in der Regel mehrere verschiedene Sigma-Faktoren, die im Allgemeinen unterschiedliche Promotorspezifitäten aufweisen. Hierdurch wird die Transkription spezieller Gene zur Anpassung an die Umweltbedingungen vermittelt. Es sind zwei Klassen von Sigma-Faktoren bekannt. Eine Klasse mit vielen Vertretern weist Homologien zum Faktor Sigma-70 der Bakterienspezies Escherichia coli auf. Eine kleinere Familie – bei den meisten Bakterien mit nur einem einzigen Vertreter – ist homolog zum E. coli-Faktor Sigma-54. Diese unterscheidet sich sowohl strukturell als auch im Mechanismus der Transkriptionsinitiation stark von der Sigma-70-Familie. Sigma-Faktoren werden durch ihre Molekülmasse charakterisiert. Der Faktor σ70 zum Beispiel beschreibt den Sigma-Faktor mit einer Molekülmasse von 70 kDa. Sigma-Faktoren aus E. coli:
* Sigma 70 ist der Haushalts- (Housekeeping-) Sigma-Faktor von E. coli, der die Transkription jener Gene einleitet, deren Genprodukte unter gewöhnlichen Umweltbedingungen benötigt werden.
* Sigma 32 ist der Hitzeschock-Sigma-Faktor in E. coli, der vom Gen rpoH codiert wird. Erhöht sich die Temperatur in der Zelle, wird der Faktor vermehrt synthetisiert. Durch die erhöhte Sigma-32-Konzentration in der Zelle bindet das Protein mit hoher Wahrscheinlichkeit an das Polymerase-Core-Enzym. Dadurch werden Hitzeschockproteine exprimiert, die der Zelle helfen, die erhöhten Temperaturen zu überleben. Zu ihnen gehören zum Beispiel Chaperone, Proteasen und DNA-Reparaturenzyme.
* Sigma 54 wird durch das Gen rpoN codiert und bei Stickstoffmangel hergestellt. Das Sigma 54-Holoenzym aktiviert unter anderem die Expression der Glutaminsynthetase, die das Schlüsselenzym für die Stickstoff-Assimilierung darstellt.
* Sigma 38 ist der Sigma-Faktor der generellen Stressantwort in E. coli. Bei Stressfaktoren wie Kohlenstoffmangel, Aminosäuremangel oder Übersäuerung wird die Sigma 38-Expression hochreguliert. Dies ist zum Beispiel der Fall, wenn eine Bakterienkultur in die stationäre Phase übergeht. Unter Sigma 38 werden Proteine exprimiert, die die Zelle vor schädigenden Umwelteinflüssen schützen. (de)
- Los factores sigma o factores σ son proteínas que se encuentran en procariontes como subunidades de la ARN polimerasa. Le permiten reconocer las secuencias promotoras del ADN para iniciar la transcripción. Los factores sigma más comunes son los factores σ70 y σ54. (es)
- A sigma factor (σ factor or specificity factor) is a protein needed for initiation of transcription in bacteria. It is a bacterial transcription initiation factor that enables specific binding of RNA polymerase (RNAP) to gene promoters. It is homologous to archaeal transcription factor B and to eukaryotic factor TFIIB. The specific sigma factor used to initiate transcription of a given gene will vary, depending on the gene and on the environmental signals needed to initiate transcription of that gene. Selection of promoters by RNA polymerase is dependent on the sigma factor that associates with it. They are also found in plant chloroplasts as a part of the bacteria-like plastid-encoded polymerase (PEP). The sigma factor, together with RNA polymerase, is known as the RNA polymerase holoenzyme. Every molecule of RNA polymerase holoenzyme contains exactly one sigma factor subunit, which in the model bacterium Escherichia coli is one of those listed below. The number of sigma factors varies between bacterial species. E. coli has seven sigma factors. Sigma factors are distinguished by their characteristic molecular weights. For example, σ70 is the sigma factor with a molecular weight of 70 kDa. The sigma factor in the RNA polymerase holoenzyme complex is required for the initiation of transcription, although once that stage is finished, it is dissociated from the complex and the RNAP continues elongation on its own. (en)
- Il fattore sigma σ è un fattore d'inizio della sintesi dell'RNA che si lega all'RNA polimerasi procariotica, permettendole di legarsi in maniera specifica solo ai promotori. Questo perché da sola, l'RNA polimerasi si legherebbe indistintamente, in qualsiasi punto del gene, trascrivendone solo una parte. Il fattore σ, infatti, possiede due domini: uno che lega il DNA e l'altro che si ancora all'RNA polimerasi, reclutandola sul promotore. Nei procarioti sono stati individuati diversi fattori σ, che permettono di variare l'espressione genica a seconda delle condizioni ambientali:
* σ70 : usato in condizioni normali per trascrivere la maggior parte dei geni;
* σS : utilizzato quando la cellula è in condizioni di stress;
* σ32 : utilizzato in condizioni di shock termico; permette la trascrizione di geni che codificano per proteine che proteggono la cellula da alte e basse temperature;
* σE : utilizzato in condizioni di shock termico;
* σ54 : utilizzato quando nella cellula si ha una carenza d'azoto;
* σ28 (σF) : utilizzato per l'espressione dell'operone dei flagelli. Il fattore principale è appunto il fattore σ70, che riconosce i promotori costituiti da due sequenze conservate poste a 10 e 35 paia di basi, a monte del sito d'inizio della trascrizione; dunque queste sequenze sono note come elementi -10 e -35 e sono separati da una sequenza spaziatrice di 17-19 nucleotidi. Esistono anche promotori che non hanno l'elemento -35, ma in compenso, presentano l'elemento -10 esteso. Il fattore σ70 è costituito da quattro regioni, di cui la 2 e la 4 riconoscono rispettivamente gli elementi -10 e -35 e la regione 3 si lega all'elemento -10 esteso, qualora presente. Il fattore sigma e l'RNA polimerasi (che da sola è chiamata apoenzima), costituiscono l'oloenzima, che interagisce con il DNA fino a incontrare il promotore, dove inizia la sintesi del'RNA. Una volta che l'oloenzima ha trascritto 10 nucleotidi, si dice che sia evaso dal promotore; il fattore sigma, quindi, si stacca e può essere usato da un nuovo apoenzima, pronto per una nuova trascrizione. (it)
- 시그마 인자(sigma factor, σ Factor)는 세균에서 전사를 개시하는데 필요한 단백질이다. 시그마 인자는 유전자의 촉진유전자에 RNA 중합효소가 특이적 결합을 가능하게 한다. 고균 전사 인자 B와 진핵 인자 TFIIB와 상동적이다. 주어진 유전자의 전사를 개시하는데 사용된 특정 시그마 인자는 유전자 및 그 유전자의 전사를 개시하는데 필요한 환경 신호에 따라 달라진다. RNA 중합효소에 의한 촉진유전자의 선택은 그것과 관련된 시그마 인자에 의존한다. 이들은 또한 세균 유사 플라스티드-암호화 된 중합효소 (PEP)의 일부로 식물의 엽록체에서 발견된다. 시그마 인자와 함께하는 RNA 중합효소는 RNA 중합 전효소(Holoenzyme)이다. 모든 RNA 중합 전효소는 하나의 시그마 인자를 가지고 있으며, 대장균은 아래에 열거 된 것 중 하나이다. 시그마 인자의 수는 세균의 종마다 다르다. 대장균에는 7개의 시그마 인자가 있다. 시그마 인자는 분자량으로 구별된다. 예를 들어, σ70 은 분자량 70kDa의 시그마 인자이다. RNA 중합 전효소의 시그마 인자는 전사의 개시에 필요하지만, 개시가 완료되면 복합체로부터 분리되고 RNA 중합효소는 RNA의 신장을 계속한다. (ko)
- Een sigmafactor (σ-factor) is een eiwit dat bij prokaryoten een belangrijke rol speelt bij het vertalen van DNA. De sigmafactor is bij de transcriptie een die verantwoordelijk is voor de specificiteit van RNA-polymerase, zodat dit aan promotors kan binden en de juiste genen kan transcriberen. Verschillende sigmafactoren worden geactiveerd als reactie op verschillende omstandigheden van het organisme. Ieder RNA-polymerasemolecuul kan met een sigmafactor binden. Van de modelbacterie E. coli zijn acht sigmafactoren bekend, maar het aantal varieert van soort tot soort en hangt samen met hoe goed een soort kan reageren op veranderende omstandigheden. Sigmafactoren worden van elkaar onderscheiden op basis van hun massa. Zo heeft σ70 een massa van 70 kDa. (nl)
- シグマ因子（σいんし）とは、真正細菌のDNA上で転写を開始する場所を決定するタンパク質。RNAポリメラーゼと結合し、プロモーター領域の特異的な配列を認識することで、どの遺伝子を読むかを決定する。通常生物はシグマ因子を多数持っており、環境に応じてその存在比率を変えることでその環境に適した遺伝子群の転写を保障している。大腸菌ではシグマ70,N,F,S,H,E,FecIの7種類が報告されている。 (ja)
- Сі́гма-фа́ктор (σ-фактор) — фактор ініціації транскрипції прокаріотів, який повиннен бути частиною білкового комплексу РНК-полімераза (РНАп) для специфічного зв'язування з ділянками промоторів на ДНК. Різні σ-фактори активізуються у відповідь на різні клітини сигнали (або природні умови). Кожний комплекс РНК-полімерази містить рівно одну субодиницю σ-фактору. Модельна бактерія Escherichia coli має як мінімум вісім σ-факторів, число σ-факторів змінюється залежно від виду бактерій та архей. Всі σ-фактори позначаються згідно з їхньою молекулярною масою, наприклад, σ70 означає σ-фактор з молекулярною вагою 70 кДа. (uk)
- O fator sigma (também de chamado de subunidade sigma) é essencial para a transcrição em procariotos já que essa subunidade reconhece regiões promotoras. O fator sigma se junta à RNA polimerase (formando a holoenzima RNA polimerase) para ocorrer a transcrição (formação da fita de RNA mensageiro). Após a junção do fator sigma à RNA polimerase, a holoenzima se colide com o DNA e é justamente o fator sigma que é responsável por se ligar à região promotora (-35 ou -10 em procariotos) do DNA para realizar a iniciação do transcrito. Se essa ligação entre holoenzima e DNA não for forte o suficiente, significa que a holoenzima não está na região promotora e então o fator sigma se colide novamente até achar o promotor para início da transcrição. Com a ligação do fator sigma à região promotora de forma correta, a transcrição pode ser iniciada. Dessa forma, existe uma subfase dentro da fase de iniciação que se chama abortiva; caso não haja adição de mais de 10 nucleotídeos, o transcrito de RNAmensageiro é abortado, mas caso haja a adição dos mais de 10 nucleotídeos o transcrito de mRNA pode seguir para a fase de alongamento. A partir desse momento, o fator sigma se solta da RNA polimerase e ela prossegue sem o fator, alongando a fita de mRNA. (pt)
- Сигма-фактор (σ-фактор) - это белок, необходимый для инициации транскрипции у бактерий.Это бактериальный фактор инициации транскрипции, который обеспечивает специфическое связывание РНК-полимеразы (RNAP) с промоторами генов. Он гомологичен фактору транскрипции B у архей и эукариотическому фактору TFIIB. Конкретный сигма-фактор, используемый для инициации транскрипции данного гена, будет варьироваться в зависимости от гена и от сигналов окружающей среды, необходимых для инициации транскрипции этого гена. Выбор промоторов с помощью РНК-полимеразы зависит от сигма-фактора, который ассоциируется с ним. Сигма-фактор вместе с РНК-полимеразой известен как РНК-полимераза-холофермент. Каждая молекула холофермента РНК-полимеразы содержит ровно одну субъединицу сигма-фактора. Количество сигма-факторов различается у разных видов бактерий. У кишечной палочки есть семь сигма-факторов. Сигма-факторы отличаются своим характерным молекулярным весом. Например, σ70 - это сигма-фактор с молекулярной массой 70 кДа. Сигма-фактор в комплексе холофермента РНК-полимеразы необходим для инициации транскрипции, хотя, как только эта стадия заканчивается, он диссоциируется от комплекса, и РНК-полимераза продолжает элонгацию самостоятельно. (ru)
- σ因子（sigma factor），原核生物RNA聚合酶上的一个亚基。可以协助聚合酶与模板链上的启动子专一性的识别并结合，极大地提高聚合酶对DNA启动子区的结合力。 (zh)
|
| rdfs:comment
|
- Els factors sigma o factors σ són proteïnes que es troben en procariotes com subunitats de l'ARN polimerasa. Li permeten reconèixer les seqüències promotores de l'ADN per iniciar la transcripció. Els factors sigma més comuns són els factors σ70 i σ54. (ca)
- Los factores sigma o factores σ son proteínas que se encuentran en procariontes como subunidades de la ARN polimerasa. Le permiten reconocer las secuencias promotoras del ADN para iniciar la transcripción. Los factores sigma más comunes son los factores σ70 y σ54. (es)
- Een sigmafactor (σ-factor) is een eiwit dat bij prokaryoten een belangrijke rol speelt bij het vertalen van DNA. De sigmafactor is bij de transcriptie een die verantwoordelijk is voor de specificiteit van RNA-polymerase, zodat dit aan promotors kan binden en de juiste genen kan transcriberen. Verschillende sigmafactoren worden geactiveerd als reactie op verschillende omstandigheden van het organisme. Ieder RNA-polymerasemolecuul kan met een sigmafactor binden. Van de modelbacterie E. coli zijn acht sigmafactoren bekend, maar het aantal varieert van soort tot soort en hangt samen met hoe goed een soort kan reageren op veranderende omstandigheden. Sigmafactoren worden van elkaar onderscheiden op basis van hun massa. Zo heeft σ70 een massa van 70 kDa. (nl)
- シグマ因子（σいんし）とは、真正細菌のDNA上で転写を開始する場所を決定するタンパク質。RNAポリメラーゼと結合し、プロモーター領域の特異的な配列を認識することで、どの遺伝子を読むかを決定する。通常生物はシグマ因子を多数持っており、環境に応じてその存在比率を変えることでその環境に適した遺伝子群の転写を保障している。大腸菌ではシグマ70,N,F,S,H,E,FecIの7種類が報告されている。 (ja)
- Сі́гма-фа́ктор (σ-фактор) — фактор ініціації транскрипції прокаріотів, який повиннен бути частиною білкового комплексу РНК-полімераза (РНАп) для специфічного зв'язування з ділянками промоторів на ДНК. Різні σ-фактори активізуються у відповідь на різні клітини сигнали (або природні умови). Кожний комплекс РНК-полімерази містить рівно одну субодиницю σ-фактору. Модельна бактерія Escherichia coli має як мінімум вісім σ-факторів, число σ-факторів змінюється залежно від виду бактерій та архей. Всі σ-фактори позначаються згідно з їхньою молекулярною масою, наприклад, σ70 означає σ-фактор з молекулярною вагою 70 кДа. (uk)
- σ因子（sigma factor），原核生物RNA聚合酶上的一个亚基。可以协助聚合酶与模板链上的启动子专一性的识别并结合，极大地提高聚合酶对DNA启动子区的结合力。 (zh)
- عامل سيغما عامل سيغما σ هو بروتين ضروري فقط لبدء تركيب الحمض النووي الريبسومي، وهو عامل تحفيزي لبدء النسخ في البكتيريا يساعد في الربط بين الإنزيم الذي يقوم بنسخ الحمض النووي (DNA Polymerase) والجينات اللازمة لبدء نسخ الحمض النووي . (ar)
- Sigma faktor (σ faktor) je podjednotka bakteriálních DNA-dependentních RNA polymeráz, která umožňuje počáteční fázi (iniciaci) transkripce a výběr promotoru. Každá bakteriální RNA polymeráza se před vlastním procesem transkripce musí navázat na sigma faktor a vzniklý komplex přisedne na promotor na vlákně DNA. Když dosáhne velikost vzniklé RNA asi 8–10 nukleotidů, tento RNA řetězec způsobí disociaci (vyvázání) sigma faktoru. Po dokončení transkripce vlákna se RNA polymeráza uvolní do cytosolu a opět může navázat nový sigma faktor. (cs)
- Sigma-Faktoren (σ-Faktoren) sind bakterielle Proteine, welche für die Initiation der Transkription notwendig sind. In der Regel sind Sigma-Faktoren in der Zelle an die RNA-Polymerase gebunden. Eine vollständige bakterielle Polymerase mit gebundenem Sigma-Faktor wird oft auch als Holoenzym bezeichnet. Sie besteht aus sechs Untereinheiten (α2ββ’ωσ). Das Minimal- oder Coreenzym dagegen ist nicht an die σ-Untereinheit gebunden. In anderen Zusammenhängen ist die Bedeutung von Holoenzym allerdings oft eine andere. Sigma-Faktoren aus E. coli: (de)
- A sigma factor (σ factor or specificity factor) is a protein needed for initiation of transcription in bacteria. It is a bacterial transcription initiation factor that enables specific binding of RNA polymerase (RNAP) to gene promoters. It is homologous to archaeal transcription factor B and to eukaryotic factor TFIIB. The specific sigma factor used to initiate transcription of a given gene will vary, depending on the gene and on the environmental signals needed to initiate transcription of that gene. Selection of promoters by RNA polymerase is dependent on the sigma factor that associates with it. They are also found in plant chloroplasts as a part of the bacteria-like plastid-encoded polymerase (PEP). (en)
- Il fattore sigma σ è un fattore d'inizio della sintesi dell'RNA che si lega all'RNA polimerasi procariotica, permettendole di legarsi in maniera specifica solo ai promotori. Questo perché da sola, l'RNA polimerasi si legherebbe indistintamente, in qualsiasi punto del gene, trascrivendone solo una parte. Il fattore σ, infatti, possiede due domini: uno che lega il DNA e l'altro che si ancora all'RNA polimerasi, reclutandola sul promotore. Nei procarioti sono stati individuati diversi fattori σ, che permettono di variare l'espressione genica a seconda delle condizioni ambientali: (it)
- 시그마 인자(sigma factor, σ Factor)는 세균에서 전사를 개시하는데 필요한 단백질이다. 시그마 인자는 유전자의 촉진유전자에 RNA 중합효소가 특이적 결합을 가능하게 한다. 고균 전사 인자 B와 진핵 인자 TFIIB와 상동적이다. 주어진 유전자의 전사를 개시하는데 사용된 특정 시그마 인자는 유전자 및 그 유전자의 전사를 개시하는데 필요한 환경 신호에 따라 달라진다. RNA 중합효소에 의한 촉진유전자의 선택은 그것과 관련된 시그마 인자에 의존한다. 이들은 또한 세균 유사 플라스티드-암호화 된 중합효소 (PEP)의 일부로 식물의 엽록체에서 발견된다. 시그마 인자와 함께하는 RNA 중합효소는 RNA 중합 전효소(Holoenzyme)이다. 모든 RNA 중합 전효소는 하나의 시그마 인자를 가지고 있으며, 대장균은 아래에 열거 된 것 중 하나이다. 시그마 인자의 수는 세균의 종마다 다르다. 대장균에는 7개의 시그마 인자가 있다. 시그마 인자는 분자량으로 구별된다. 예를 들어, σ70 은 분자량 70kDa의 시그마 인자이다. (ko)
- O fator sigma (também de chamado de subunidade sigma) é essencial para a transcrição em procariotos já que essa subunidade reconhece regiões promotoras. O fator sigma se junta à RNA polimerase (formando a holoenzima RNA polimerase) para ocorrer a transcrição (formação da fita de RNA mensageiro). (pt)
- Сигма-фактор (σ-фактор) - это белок, необходимый для инициации транскрипции у бактерий.Это бактериальный фактор инициации транскрипции, который обеспечивает специфическое связывание РНК-полимеразы (RNAP) с промоторами генов. Он гомологичен фактору транскрипции B у архей и эукариотическому фактору TFIIB. Конкретный сигма-фактор, используемый для инициации транскрипции данного гена, будет варьироваться в зависимости от гена и от сигналов окружающей среды, необходимых для инициации транскрипции этого гена. Выбор промоторов с помощью РНК-полимеразы зависит от сигма-фактора, который ассоциируется с ним. (ru)
|
